Na zemědělských farmách minulého století se farmáři spoléhali na přírodní procesy, aby oplodnili a chránili své farmy. V polovině 20. století přinesla Zelená revoluce do zemědělství novou technologii, která zemědělcům umožnila vyrábět více potravin na méně půdě, spoléhat se na chemické látky k ochraně plodin a hospodářských zvířat před chorobami a škůdci a přimět farmy k růstu od rodinných podniků až po průmyslové operace. Přestože farmy nyní vyrábějí velké množství potravin za málo peněz, tyto nové metody nebyly bez dopadu.
Živočišný hnůj
Tradičně fungují farmy jako uzavřený systém. Zemědělci rostli plodinami, které krmily zvířata, a zvířata produkovala hnůj, který živil novou generaci plodin. Jak David A. Fahrenthold ve Washington Post vysvětluje, změny v zemědělství v USA posunuly úlohu hnojiva z hnojiva na toxický odpad, protože malé farmy ustupují k velkým operacím s tisíci zvířat produkujícími více hnoje, než je možné použít. Podle Fahrentholda je odtok hnojiv jednou z hlavních příčin vodních mrtvých oblastí. Americké ministerstvo zemědělství dodává, že odtok hnojiv také přispívá k vypuknutí choroby přenášené potravinami, když zvířecí odpady znečišťují pole používané k pěstování plodin.
Odstraňování hnojiv
Stejně jako hnůj, ve vhodných množstvích, hnojivo podporuje zdravý růst rostlin. Nicméně nadměrné používání a zneužívání hnojiv s vysokým obsahem dusíku a fosforu má také zničující důsledky pro životní prostředí a lidské zdraví. Podle Státní univerzity Severní Karolíny přispívá znečištění hnojivami k vodním mrtvým zónám, oblastem ve vodách, kde živé organismy nemohou přežít. Dokonce i ve vodě mají hnojiva svůj zamýšlený účinek: zvyšují růst rostlin. Zvýšený růst řas však spotřebovává kyslík potřebný jinými organismy. Navíc, když se hnojiva vylupují do podzemních vod, může dojít ke vzniku syndromu modrý-dítě, smrtelný stav u malých dětí.
Prach
Vzhledem k tomu, že se živočišné farmy zvětšují, množství prachu, které produkují, dosahuje potenciálně nebezpečných úrovní. Jak půda, tak hnůj, když jsou vysušeny, se mohou vyskytovat ve vzduchu jako prach, nesoucí patogeny na sousední vlastnosti. Riziko prachu je obzvláště vysoké pro zemědělce a pracovníky. Podle Penn State Cooperative Extension, stav nazvaný "farmářova plic", způsobený vdechováním škodlivých částic, může způsobit trvalé poškození plic a dokonce i smrt.
Pesticidy
Ze své podstaty jsou pesticidy jedy, které mají zabíjet obtěžující hmyz a zvířata, která ničí plodiny. Když pesticidy kontaminují vodu, mohou způsobit škodlivé účinky i na lidi i zvířata. Podle Iowa State University Extension Service, pesticidy mohou dosáhnout vody několika způsoby. Pesticidy rozstřikované na plodiny se mohou dostat do rybníků a potoků. Rovněž dochází k vyplavování, přičemž pesticidy se vyplachují do povrchových vod, odvádějí se erozí půdy nebo vyluhují do zásob podzemních vod.