Banky zpracovávají kontroly, které zákazníci ukládají s nimi. Bankovní oddělení pro kontrolu šeků vymaže kontroly. Použití papírových šeků je podle Federální rezervní banky v New Yorku nahrazeno použitím elektronických platebních metod a počet kontrol psaných ve Spojených státech klesá od poloviny 90. let. Zda je kontrola zpracována jako kontrola papíru nebo zpracována elektronicky, nicméně funkce banky při vymazání šeku zůstává stejná.
Stejné bankovní šeky
Tyto kontroly, nazvané "on-us" šeky, jsou uloženy na stejné finanční instituci. To představovalo 20 procent kontrol, které byly vyplaceny v roce 2006, podle Federální rezervní banky v New Yorku. Chcete-li vymazat šeky "on-us", bankovní oddělení zúčtování provádí správné položky v knihách, aby připsaly na účet vkladatele a aby debetovaly účet plátce.
Interbankové šeky
Jedná se o kontroly, které jsou uloženy a kresleny na dvou různých bankách. Tyto druhy šeků představovaly 80 procent šeků vyplacených v roce 2006, tvrdí Federální rezervní banka v New Yorku. Pro vymazání těchto mezibankovních šeků může bankovní zúčtovací oddělení předložit šeky přímo bankovnímu šeku nebo je předat korespondenčnímu subjektu. Mohla by si také vyměňovat šeky u skupiny bank, které se účastní zúčtovací dohody. Nebo by mohla předat šek na federální rezervní banku.
Elektronické zpracování
V uplynulých letech se počet kontrolovaných papírových šeků snížil a využívaly se více elektronických plateb. Při elektronickém zpracování banky nemusí provádět přepravu a zpracování papírových šeků. Na základě tohoto trendu snižují Federální rezervní banky počet míst, kde zpracovávají papírové šeky. Pohyb směrem k elektronickému kontrolnímu zpracování získal trakci s Check Clearing pro zákon o 21. století z roku 2004. Tento zákon zavedl koncept náhradní kontroly, což je papírová kopie přední a zadní části šeku, který je právním ekvivalentem originální kontrola papíru. Zákon z roku 2004 umožnil bankám zpracovávat šeky elektronicky s tím, že pokud se v procesu zúčtování šeku setkají s institucí, která vyžaduje kontrolu papíru, poskytnou mu náhradní kontrolu.
